Margarete Haider betätigte sich ab Juli 1944 für die überparteiliche Widerstandsgruppe "Freies Österreich" um den Schriftsteller Karl Gruber (geb. 1888). Sie wurde am 25. 9. 1944 festgenommen und am 5. 10. 1944 von der Gestapo Wien erkennungsdienstlich erfasst. Am 3. 4. 1945 konnte sie während eines Häftlingstransports flüchten.